Agarose Type I, low EEO

Sinônimo(s):

3,6-Anhydro-α-L-galacto-β-D-galactan, Agarose LE

About This Item

Número CAS:

9012-36-6

Número CE:

232-731-8

Número MDL:

MFCD00081294

Código UNSPSC:

41105317

ID de substância PubChem:

24891047

NACRES:

NA.25

fonte biológica

algae (Gelidium & Gracilaria)

Nível de qualidade

200

tipo

Type I

forma

powder

técnica(s)

electrophoresis: suitable

Impurezas

≤10% water

EEO

0.09-0.13

temperatura de transição

gel point 36 °C ±1.5 °C (1.5% gel)

força do gel

≥1200 g/cm² (1% gel)

traços de ânion

sulfate (SO₄^2-): ≤0.15%

adequação

suitable for electrophoresis

InChI

1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1

chave InChI

MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N

Descrição geral

Agarose is a polymer isolated from red seaweed, from the species Gelidium and Gracilaria, and it is commonly used for the separation of nucleic acids. Type I agarose is often utilized in molecular biology to make agarose gels for electrophoresis, a technique used to separate and analyze DNA or RNA fragments or proteins based on their size. Agarose may also be used in plant cell culture to create hydrogels, which are gel-like materials that provide a three-dimensional matrix. This provides a supportive and biocompatible environment for plant cells, this mimics physiological conditions and conducts experiments in vivo. They are versatile for various applications in plant biology, such as studying cell growth, tissue culture, and analyzing plant responses to different stimuli.

Aplicação

Type 1 Agarose is commonly utilized for molecular biology:

• for gel electrophoresis of DNA and RNA molecules[1][2]

• for agarose overlay in cell culture, to measure antibacterial activity by radial diffusion[3]

• for agarose overlay in cell culture for radio immunodiffusion assays to quantify antigens[4]

• for agarose overlay in plaque assays to determine viral titer

• to prepare agarose hydrogel that encapsulates a viscous media for 3D cell culture[5]

• as an ingredient of human-tissue-like MRI phantoms[6]

• for diagnostic to analyze patient samples for MRSA genome using pulsed-field gel electrophoresis[2]

Características e benefícios

• Low EEO agarose is useful for routine analysis of nucleic acids

• Suitable for electrophoresis: DNase & RNase free

• Suitable for plant cell culture

• Suitable for mammalian cell culture

Nota de análise

Tem-se a seguir uma lista das propriedades associadas com as nossas agaroses:
Teor de sulfato - usado como indicador de pureza, uma vez que o sulfato é o principal grupo iônico presente.
Força do gel - a força que deve ser aplicada a um gel para que se frature.
Ponto de gel - a temperatura na qual uma solução de agarose aquosa forma um gel ao se resfriar. Soluções de agarose exibem histerese na transição líquido para gel, ou seja, o seu ponto de gel não é o mesmo que a sua temperatura de fusão.
Eletroendosmose (EEO) - um movimento de líquido através do gel. Grupos aniônicos em um gel de agarose são afixados à matriz e não podem se mexer, mas contracátions dissociáveis podem migrar no sentido do cátodo na matriz, o que dá origem à EEO. Como o movimento eletroforético de biopolímeros é, em geral, no sentido do ânodo, a EEO pode perturbar separações em função da convecção interna.